Kit genotyping na luchaige
Àireamh cat: HCR2021A
Is e pasgan a th’ anns an toradh seo a chaidh a dhealbhadh airson a bhith ag aithneachadh genotypes luchag gu sgiobalta, a’ toirt a-steach às-tharraing amh DNA agus siostam leudachaidh PCR.Faodar an toradh a chleachdadh airson leudachadh PCR gu dìreach bho earball na luchaige, cluais, ladhar agus stuthan eile às deidh sgoltadh sìmplidh le Lysis Buffer agus Proteinase k.Gun cnàmhadh thar oidhche, às-tharraing phenol-chloroform no glanadh colbhan, a tha sìmplidh agus a ’giorrachadh ùine deuchainnean.Tha an toradh freagarrach airson leudachadh air pìosan targaid suas gu 2kb agus ath-bheachdan PCR ioma-fhillte le suas ri 3 paidhrichean de primers.Anns a’ mheasgachadh PCR dìreach 2 × inneal-luchag tha DNA polymerase a chaidh innleachadh gu ginteil, Mg2+, dNTPs agus siostam bufair làn-leasaichte gus èifeachdas leudachaidh àrd agus fulangas casg a thoirt seachad, gus an urrainnear ath-bheachdan PCR a dhèanamh le bhith a’ cur teamplaid agus primers ris agus ag ath-uisgeachadh an toraidh gu 1 ×.Tha bunait follaiseach “A” aig an toradh PCR a tha air a mheudachadh leis an toradh seo aig ceann 3 ′ agus faodar a chleachdadh gu dìreach airson clonadh TA às deidh glanadh.
Co-phàirtean
Comh-phàirt | Meud |
2 × Measgachadh PCR dìreach clò-bhualadair na luchaige | 5 × 1.0 mL |
Lysis Buffer | 2 × 20mL |
Pròtain K | 800 μL |
Cumhachan stòraidh
Bu chòir bathar a stòradh aig -25 ~ -15 ℃ airson 2 bhliadhna.Às deidh leaghadh, faodar Lysis Buffer a stòradh aig 2 ~ 8 ℃ airson ioma-chleachdadh geàrr-ùine, agus measgachadh gu math nuair a bhios tu a ’cleachdadh.
Iarrtas
Tha an toradh seo freagarrach airson mion-sgrùdadh luchainn, lorg transgenic, genotyping agus mar sin air adhart.
Feartan
1.Obrachadh sìmplidh: chan eil feum air DNA genomic a thoirt a-mach;
2.Iarrtas farsaing: freagarrach airson leudachadh dìreach air diofar stuthan luchag.
Stiùiridhean
1.Sgaoileadh DNA genomic
1) Ag ullachadh lysate
Thathas ag ullachadh lysate meitabileach a rèir an àireamh de shamhlaichean luchag a tha rin lysate (bu chòir lysate maothraidh ullachadh air an làrach a rèir an dòs agus measgachadh gu mionaideach airson a chleachdadh), agus tha a’ chuibhreann de ath-bheachdan a tha a dhìth airson aon shampall mar a leanas:
Co-phàirtean | Meud (μL) |
Pròtain K | 4 |
Lysis Buffer | 200 |
2) Eisimpleir Ullachaidh agus Lysis
Cleachdadh Fìne a tha air a mholadh
Seòrsa deSgiath | Meud air a mholadh |
Earball na luchaige | 1-3mm |
Cluas na luchaige | 2-5mm |
ladhar na luchaige | 1-2 pìosan |
Gabh tomhas iomchaidh de shamhlaichean clò luchag ann an tiùban centrifuge glan, cuir 200μL de lysate clò ùr gu gach tiùb centrifuge, vortex agus crathadh, an uairsin goir aig 55 ℃ airson 30m, agus an uairsin teas aig 98 ℃ airson 3 mionaidean.
3) Centrifugation
Crith an lysate gu math agus an centrifuge aig 12,000 rpm airson 5 mionaidean.Faodar an supernatant a chleachdadh mar theamplaid airson leudachadh PCR.Ma tha feum air an teamplaid airson a stòradh, gluais an supernatant gu tiùb centrifuge sterile eile agus stòr aig -20 ℃ airson 2 sheachdain.
2.Meudachadh PCR
Thoir air falbh am measgachadh PCR Direct 2 × fìnealta na luchaige bho -20 ℃ agus leaghadh air deigh, measgachadh bun os cionn agus ullaich an siostam freagairt PCR a rèir a ’chlàir a leanas (obraich air deigh):
Co-phàirtean | 25μLSiostam | 50μLSiostam | Tùsachadh Deireannach |
2 × Measgachadh PCR dìreach clò-bhualadair na luchaige | 12.5 μL | 25 µL | 1 × |
Primer 1 (10μM) | 1.0 μL | 2.0 μL | 0.4 μM |
Primer 2 (10μM) | 1.0 μL | 2.0 μL | 0.4 μM |
Bathar Cleavagea | Mar a dh 'fheumar | Mar a dh 'fheumar |
|
dhh2O | Suas gu 25 μL | Suas gu 50 μL |
|
Thoir an aire:
a) Cha bu chòir an t-suim a chaidh a chur ris a bhith nas àirde na 1/10 den t-siostam, agus ma thèid cus a chur ris, dh’ fhaodadh gun tèid casg a chuir air leudachadh PCR.
Cùmhnantan PCR air am moladh
Ceum rothaireachd | Temp. | Uair | Rothaichean |
Dì-nàdarachadh tùsail | 94 ℃ | 5 mionaidean | 1 |
Dì-nàdarachadh | 94 ℃ | 30 diog | 35-40 |
Annealinga | Tm + 3 ~ 5 ℃ | 30 diog | |
Leudachadh | 72 ℃ | 30 diog/kb | |
Leudachadh deireannach | 72 ℃ | 5 mionaidean | 1 |
- | 4 ℃ | Cùm | - |
Thoir an aire:
a) Teòthachd annealing: A thaobh luach Tm an primer, thathas a’ moladh an teòthachd annealing a shuidheachadh gu luach Tm nas lugha den primer +3 ~ 5 ℃.
Duilgheadasan Coitcheann agus Fuasglaidhean
1.Gun stiallan cuimsichte
1) Toradh lysis cus.Tagh an àireamh de theamplaid as iomchaidh, mar as trice chan eil barrachd air 1/10 den t-siostam;
2) Meud sampall ro mhòr.Dilute an lysate 10 tursan agus an uairsin leudaich, no lughdaich meud an t-sampall agus ath-lysis;
3) Chan eil sampallan clò-bhualaidh ùr.Thathas a’ moladh sampallan clò ùr a chleachdadh;
4) droch chàileachd primer.Cleachd DNA genomic airson leudachadh gus càileachd primer a dhearbhadh agus dealbhadh primer a bharrachadh.
2.Meudachadh neo-shònraichte
1) Tha an teòthachd annealing ro ìosal agus tha an àireamh baidhsagal ro àrd.Meudaich an teòthachd annealing agus lughdaich an àireamh de chuairtean;
2) Tha dùmhlachd teamplaid ro àrd.Lùghdaich an àireamh de theamplaid no caolaich an teamplaid 10 tursan às deidh an leudachadh;
3) Sònrachas primer truagh.Dèan an dealbhadh primer as fheàrr.
Notaichean
1.Gus tar-thruailleadh eadar sampallan a sheachnadh, bu chòir grunn innealan samplachaidh ullachadh, agus faodar uachdar nan innealan a ghlanadh le fuasgladh sodium hypochlorite 2% no inneal-glanaidh searbhag niuclasach às deidh gach samplachadh ma tha feum air a-rithist.
2.Thathas a’ moladh innealan luchag ùra a chleachdadh, agus cha bu chòir an tomhas samplaidh a bhith ro mhòr gus nach toir e buaidh air toraidhean leudachaidh.
3.Bu chòir do Lysis Buffer reothadh tric a sheachnadh, agus faodar a stòradh aig 2 ~ 8 ℃ airson ioma-chleachdadh geàrr-ùine.Ma thèid a stòradh aig teòthachd ìosal, faodaidh sileadh tachairt, agus feumar a sgaoileadh gu tur mus tèid a chleachdadh.
4.Bu chòir PCR Mix reothadh tric a sheachnadh, agus faodar a stòradh aig 4 ℃ airson ath-chleachdadh geàrr-ùine.
5.Chan eil an toradh seo ach airson sgrùdadh deuchainneach saidheansail agus cha bu chòir a chleachdadh ann am breithneachadh no làimhseachadh clionaigeach.